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技術文章

從72小時到48小時——拉曼-重水同位素探針技術如何革新抗癌藥物篩選

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傳統抗癌藥物體外敏感性測試,耗時長、假陽性率高,且無法捕捉腫瘤細胞的個體差異。中科院蘇州醫工所宋一之團隊聯合牛津大學等機構在《Biosensors》期刊發表了一項突破性研究——利用單細胞拉曼光譜結合重水(D?O)標記技術(Raman-DIP),將藥敏檢測周期從72–144小時縮短至48小時,并在單細胞水平上揭示了腫瘤細胞對化療藥物的異質性應答。

一、傳統藥敏檢測的三大痛點


目前主流的體外藥敏檢測方法(如MTT、CCK-8、CTG等)通過檢測細胞氧化還原酶活性或ATP含量來評估細胞活力。然而,這些方法存在三個難以逾越的瓶頸:
痛點一:假陽性率高。試劑本身的細胞毒性、氧化應激等因素會干擾檢測結果,導致“假敏感"或“假耐藥"的判斷。
痛點二:耗時長。傳統方法需要等待細胞增殖或死亡,通常耗時72–144小時。對于腫瘤患者而言,漫長的等待可能延誤最佳治療時機。
痛點三:無法反映單細胞異質性。腫瘤是由具有不同遺傳和代謝特征的細胞亞群組成的混合群體。傳統群體檢測將所有細胞“平均化",掩蓋了耐藥亞群的存在,而這恰恰是治療失敗的主要原因。


二、Raman-DIP:用“代謝指紋"代替“細胞計數"

(1) 方法學建立:用“碳-氘(C-D)指紋峰"量化單細胞代謝


傳統拉曼檢測的是細胞固有的蛋白質、脂質、核酸信號,但癌細胞是否“吃"了重水(D?O),才是判斷其代謝活性的關鍵。
ü標記原理:研究將HCC827(人非小細胞肺癌)和MCF-7(人乳腺癌)細胞置于含D?O的培養基中。代謝旺盛的細胞在合成新脂質和蛋白質時,會將D?O中的氘(D)原子固定到碳鏈上,形成碳-氘(C-D)共價鍵
ü光譜指征:我們的拉曼光譜儀在2000~2300 cm?1的“生物靜默區"(該區域細胞自身沒有干擾峰)清晰地捕捉到了一個全新的特征峰(~2170 cm?1)。該峰強度直接與細胞內新合成的生物大分子量成正比。峰強越高,細胞代謝越旺盛;峰強下降,則說明藥物起效了。如圖所示,即使在5% D?O濃度下,細胞在~2170 cm?1處即出現清晰的C-D特征峰,且峰強隨D?O濃度升高而增強。
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圖1:不同濃度D?O培養下HCC827細胞的單細胞拉曼光譜
ü計算模型:研究創新性地定義了“代謝指數(Metabolic Index)",公式為:
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歸一化處理消除了細胞厚度和激光焦點差異帶來的誤差,使得不同細胞間的代謝數據具備高的可比性。如圖所示,代謝活性在D?O標記12小時后即可被拉曼光譜清晰檢測到。
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圖2:30% D?O培養不同時間下HCC827細胞的單細胞拉曼光譜


(2) C-D峰強度 = 細胞代謝活性的“實時儀表盤"


與傳統方法相比,Raman-DIP實現了三大突破:
(1)速度突破:研究團隊對HCC827(人非小細胞肺癌細胞系)和MCF-7(人乳腺癌細胞系)兩種細胞系進行了測試。結果顯示,Raman-DIP將整個藥敏測試周期從傳統方法的72~144小時縮短至48小時。(數據顯示:12小時標記已足夠檢出C-D信號;24小時標記后代謝指數趨于穩定,因此24小時被確定為最佳標記時間)
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圖3:30% D2O培養不同時間下HCC827(B)和MCF-7(D)的單細胞代謝指數
(2)精度突破:研究團隊對150個單細胞進行逐一拉曼掃描,發現在同一種高濃度藥物處理下,絕大多數細胞代謝被抑制,但仍有約1%的細胞保持著強烈的C-D信號——這些正是潛在的耐藥亞群
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圖4:不同濃度Crizotinib處理下150個單細胞HCC827的代謝比率分布
(3) 這種單細胞異質性分析是傳統群體檢測無法實現的。
(4)可靠性突破:拉曼-DIP無需有毒染色試劑,從根本上避免了傳統方法的假陽性問題。研究團隊用8種抗癌藥物在兩種癌細胞系(HCC827和MCF-7)上驗證,結果顯示Raman-DIP與傳統金標準CTG法的藥敏判定結果100%一致(靈敏度、特異性、準確率均達1.0)。


三、我們的拉曼系統,為Raman-DIP而生


這項技術的落地,離不開一臺“懂細胞、懂代謝"的拉曼光譜儀。我們的(OpenRam HR300)共焦拉曼顯微鏡系統,正是為了這樣的應用場景而設計:


1.單細胞級分辨力


配備532nm/785nm雙波長激發,兼顧靈敏度和熒光背景抑制;
共焦設計保證≤1 μm的空間分辨率,輕松鎖定單個貼壁或懸浮細胞;
高精度電動載物臺(0.1 μm步進),支持高通量自動尋位和批量譜圖采集。


2.寬譜段、高信噪比


光譜覆蓋范圍400~3400 cm?1,完整覆蓋C-H、C-D、苯丙氨酸等關鍵生物標志峰;
采用深制冷CCD探測器,積分時間僅需2秒即可獲得清晰C-D信號,有效降低光漂白和光損傷。


3.活細胞培養與環境控制模塊(選配)


可集成溫控、CO?和濕度控制單元,讓細胞在測量全程保持正常生理狀態;
兼容多孔板(96/384孔)或鋁鍍膜玻片,與現有的細胞培養流程無縫銜接。
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OpenRam HR300多擴展行顯微共聚焦拉曼光譜儀


參考文獻:Wang, J.; Lin, K.; Hu, H.; Qie, X.; Huang, W.E.; Chen, Z.; Gong, Y.; Song, Y. Single-Cell Raman-Deuterium Isotope Probing for Rapid Anticancer Drug Efficacy Sensing. Biosensors2021, *11*(8), 286.


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